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genaxxon M3009.0000说明书

 更新时间:2019-11-29 点击量:792

genaxxon M3009.0000说明书

SNP Pol DNA-Polymerase

M3009.0000

产品信息“ SNP Pol DNA聚合酶”

SNP Pol DNA聚合酶用于等位基因的简单,可靠和快速特异性分化,例如。CRISPR / Cas9点突变,检测不正确的CRISPR / Cas9产品,或验证测序结果。无论是否存在引物模板复合物不匹配,SNP Pol DNA聚合酶都能识别高度特异性。错配(点突变)必须在引物的3'末端。因此,突变等位基因可以与野生型等位基因*区分开- 无需测序,因为在错配的情况下聚合酶根本不会扩增。

只需将引物放在假定的点突变上(重要:点突变必须在3'末端),聚合酶将以100%的准确性检测该区域的错配:如果与引物3'末端互补的碱基在DNA上链显示突变而引物未显示,则没有扩增发生-快速100%确定!
因此,SNP Pol DNA聚合酶可轻松,省时且经济地用于筛选点突变。

SNP PolTaq DNA聚合酶变异体具有5'-3'核酸酶活性,因此可与特异性引物探针(如Taqman®探针或分子信标)一起使用。

一次性测试模式可享受*。在德国境内免运费!试用样品价格将在产品正式订购时退还。

描述
的SNP波尔DNA聚合酶(您好 GH 单核苷酸scrimination)是高度选择性的DNA聚合酶。它是专为需要较高区分率的等位基因特异性区分而设计的,例如等位基因特异性PCR(ASA),等位基因特异性引物延伸(AS-PEX),SNP分析,基因分型或甲基化特异性PCR(MSP)。许多DNA聚合酶可耐受错配的引物-模板复合物。另一方面,SNP Pol DNA聚合酶可以区分这些特异性(高区分度),并且仅特异性地提供引物对*匹配的PCR产物!Genaxxon SNP Pol和SNP PolTaq DNA聚合酶通过两个等位基因之间的等位基因特异性PCR差异高达100%,并且在简单的qPCR之后,可以清楚地说明存在哪些等位基因。

等位基因特异性PCR可用于定量野生型序列库或背景中的突变率。同样,可以通过等位基因特异性PCR和SNP Pol DNA聚合酶验证由NGS确定的突变频率。SNP PolTaq DNA聚合酶非常适合用于液体活检样品的分析有了它,就可以很好地分析和量化癌症突变的存在和频率。

图片:应用实例SNP Pol DNA聚合酶

HiDi DNA聚合酶的应用说明

我们建议使用短扩增子(约60-200 bp)的引物以获得结果。更长的扩增子也是可能的。
对于大于500 bp的较长扩增子,可能需要添加镁(+0.5-1.5mM)。

故障排除:
PCR 30个循环后无条带!
缺失或弱带的优化程序

-实时PCR方法
-检查dNTP浓度。这应该在200至300μM之间(在PCR中)。
-增加循环次数(至少35次,40次)

测试优化- 
循环数在端点检测中,循环数30并不总是足以产生高度可见的条带。例如,以少于200个DNA拷贝为基线。因此,应该使用实时PCR运行测试,或者可以使用五个并行PCR,其中五个是在五个不同的循环后从PCR设备中提取的(以下示例)。

终点检测:
用SNP Pol DNA聚合酶并行进行五个相同的PCR反应。
分别在20、25、30、35和40个循环中,从循环仪中取出一个PCR管,后将所有五个反应加到琼脂糖凝胶上。
这样就可以很容易地看出,对于给定的应用(起始材料,靶标,引物),PCR中的循环数是多少。

带细胞裂解物的SNP Pol PCR
动物细胞和大肠杆菌可直接用于SNP Pol DNA聚合酶的PCR!不需要单独的裂解和蛋白酶K消化。
程序PCR方法:

1.每个PCR方法需要50-500个细胞!
2.用引物和缓冲液准备PCR混合物,并置于冰上!
3.将挑选的菌落直接倒入10-20μL水中(不进行单独的裂解,不进行蛋白酶K消化),
短暂涡旋(5秒),然后将该细胞悬液直接加入PCR反应中,例如将
10μL的细胞悬液用于PCR总体积接近20μL。2-3分钟的初始变性时间
就足够了,如果需要,可以延长至5分钟。
每个反应的大基因组DNA。100份相对较小,但仍然可以使用。
该细胞悬浮液的其余部分也可以冷冻掉以进行进一步测试。

可选: 
4.如果可能:进行实时PCR!

SNP Pol DNA聚合酶(M3009>)或(M3061>)可与非特异性荧光染料(例如Genaxxon的Green DNA Dye>或SybrGreen®)一起用于实时PCR。当使用特定的PCR探针时,只能使用SNP PolTaq DNA聚合酶,因为只有这种酶才具有5'-3'核酸外切酶活性。

使用我们高质量的dNTP套装(M3015.4100和M3015.0250)或混合物(M3016.1010)>或我们的DNA标记>以及我们有利的标准琼脂糖>,我们为您提供PCR的其他产品。

SNP Pol DNA聚合酶的应用领域
-监测,验证和检测点突变
-鉴定正确或错误的CRISPR / Cas9产品
-验证/确认测序结果
-定量突变(例如NGS结果)
-通过等位基因检测SNP特异性扩增(ASA)/等位基因特异性PCR- 
亚硫酸氢盐处理过的DNA(CpG甲基化侧)后的甲基化特异性PCR(MSP)
-HLA基因分型
-微测序
-带有水解探针的实时PCR- 
实时多重PCR

线虫DAMID-SEQ数据。

Sharma R,Ritler D,Meister P. 
秀丽隐杆线虫发育过程中核组织的DNA腺嘌呤甲基转移酶鉴定分析工具。创世纪。2016年2月4日。doi:10.1002 / dvg.22925。

-用SNPase DNA聚合酶进行SNP基因分型的小测序可通过以下步骤进行:

Lovmar L,Fredriksson M,Liljedahl U,Sigurdsson S,SyvänenAC。
通过微测序和微阵列的定量评估揭示了整个基因组扩增DNA的准确多重SNP基因型。Nucleic Acids Res。2003; 31:e129 

-HiDi DNA聚合酶的等位基因特异性错配选择性

鼓M,Kranaster R,Ewald C,Blasczyk R,Marx A(2014)Thermus aquaticus DNA聚合酶的变体,具有在等位基因和甲基化特异性扩增中应用的增加的选择性。公共科学学报9(5):e96640。DOI:10.1371 / journal.pone.0096640