Product | 50 nmol scale | 200 nmol scale | 1 umol scale | 2 umol scale | 10 umol scale | 15 umol scale |
Catalog No. | 26-6400-05 | 26-6400-02 | 26-6400-01 | 26-6400-03 | 26-6400-10 | 26-6400-15 |
Unmodified Oligonucleotides | $0.50 | $0.90 | $1.95 | $2.95 | $19.50 | $27.65 |
Maximum Length of Synthesis | 80 mer | 120 mer | 200 mer | 250 mer | 250 mer | 250 mer |
凝胶纯化
如果应用将用于PCR或测序,则所有短于40 mer的Gene Link寡核苷酸都不需要进一步纯化。以99.5%的偶联效率合成的20 mer寡核苷酸将包含〜90%的全长20 mer和〜10%的截短序列的混合物。随着寡核苷酸长度的增加,即使在99.5%的偶联效率下,全长寡核苷酸的产量也会降低。60 mer原油产品将包含〜75%的全长寡核苷酸,同样,100 mer将包含〜60%。强烈建议对50 mer以上的寡核苷酸进行纯化。
产品 | 50 nmol规模 | 200 nmol规模 | 1 umol量表 | 2摩尔规模 | 10 umol量表 | 15 umol量表 |
货号(PAGE) | 26-6400-77 | 26-6400-77 | 26-6400-55 | 26-6400-88 | 26-6400-44 | 26-6400-99 |
凝胶纯化(PAGE) | 75.00 | 75.00 | 150.00 | 280.00 | 1500.00 | 1800.00 |
货号(RPC) | 26-6400-11 | 26-6400-11 | 26-6400-22 | 26-6400-23 | 26-6400-33 | 26-6400-34 |
反相纯化(RPC) | 30.00 | 30.00 | 90.00 | 170.00 | 750.00 | 900.00 |
原油脱盐 | RPC纯化** | 凝胶纯化 | |||||||||||||
20 mer oligo 典型产量 | 30 mer oligo 典型产量 | 50 mer oligo 典型产量 | |||||||||||||
规模 | A 260伙 | 纳摩尔 | 毫克 | A 260伙 | 纳摩尔 | 毫克 | A 260伙 | 纳摩尔 | 毫克 | ||||||
50纳摩尔 | 8-10 | 30+ | 0.2-0.3 | 4-5 | 12+ | 0.1-0.16 | NR * [1-2] | NR * [2-4] | NR * [0.03-0.06] | ||||||
200纳摩尔 | 20-25 | 80+ | 0.6-0.8 | 8-12 | 24+ | 0.26-0.4 | 4-6 | 8+ | 0.13-0.2 | ||||||
1 ü摩尔 | 100-120 | 400+ | 3-4 | 40-50 | 90+ | 1.3-1.6 | 20-25 | 40+ | 0.6-0.8 | ||||||
2 û摩尔 | 200-240 | 800+ | 6-8 | 80-100 | 180+ | 2.5-3.1 | 40-50 | 80+ | 1.2-1.5 | ||||||
10 ù摩尔 | 〜1000 | 〜4000 | 〜30 | 〜400 | 〜900 | 〜10 | 〜200 | 〜400 | 〜60 | ||||||
15 ù摩尔 | 〜1500 | 〜6000 | 〜45 | 〜600 | 〜1350 | 〜15 | 〜300 | 〜600 | 〜90 | ||||||
纯度和产率 | 纯度大于80% 取决于寡核苷酸的序列和结构。有关寡核苷酸长度相关的纯度和产率,请参见偶联效率表。 PCR和测序应用无需进一步纯化。 凝胶纯化建议用于50 mer以上的寡核苷酸以及涉及克隆和诱变的所有应用。 ** RPC是使用药筒进行的反相纯化;HPLC的替代品。 | 纯度85%至95% 取决于寡核苷酸序列和结构 GC含量高的序列的收率和纯度会更低 不建议用于35 mer以上的寡核苷酸。 ** RPC是使用药筒进行的反相纯化;HPLC的替代品。 | 纯度98%至〜100% 取决于寡核苷酸序列和结构 随着寡核苷酸长度的增加,产量将逐渐降低。回文,发夹和高GC含量的寡核苷酸以及包含3个或更多G链的寡核苷酸会诱导强烈的二级结构和碱基堆积,从而降低纯度和产量。 *不推荐NR | ||||||||||||
*一个。表中列出的典型产量是未修饰的随机序列寡核苷酸。使用高GC含量的寡核苷酸和形成强二级结构的寡核苷酸可观察到产量降低。 b。改性寡核苷酸预计产量会降低。减少百分比随修改类型和站点数量而变化。每个修饰位点的典型减少量为10%-20%。 C。对于等摩尔的碱基组成,计算出的DNA寡核苷酸的产量为33µg / A260。单基或均聚物的长拉伸将具有可变的产率。均聚物20 mer的示例:dA(20)=〜25ug / A260单位;dC(20)=〜40ug / A260单位; dG(20)=〜32ug / A260单位和dT(20)=〜37 ug / A260单位 |
合成后修饰的共轭/转化(NHS,硫醇,马来酰亚胺等)的合成和产率规模
Most oligo modifications are directly coupled using optimized automated DNA synthesis protocols that are suited for specific modifications. The final yield varies and are usually around 80% of the yield of the unmodified oligos. Multiple modifications and sites in the same oligo may lead to further reduction in final yield.
Certain modification (e.g Alexa fluorescent dyes, digoxigenin, etc) are not available for direct autoamted coupling chemsitry and have to be conjugated using post synthesis methods involving amino group to NHS (N - hydroxysuccinimide) ester, thiols to maleimide and other post synthesis conversions.
这些合成后的共轭反应动力学可产生约60-85%的终产物,建议使用聚丙烯酰胺凝胶纯化。这些合成后缀合的收率指南在下面列出。
RPC纯化** | 凝胶纯化 | ||||||||||||||
20-40 mer oligo 典型产量 | 20-40 mer oligo 典型产量 | ||||||||||||||
规模 | A 260伙 | 纳摩尔 | 毫克 | A 260伙 | 纳摩尔 | 毫克 | |||||||||
50纳摩尔 | 〜2 | 〜4 | 〜0.06 | 〜1 | 〜2 | 〜0.03 | |||||||||
200纳摩尔 | 〜4 | 〜8 | 〜0.12 | 〜2.5 | 〜5 | 〜0.07 | |||||||||
1 ü摩尔 | 〜12 | 〜24 | 〜0.36 | 〜8 | 〜16 | 〜0.24 | |||||||||
2 û摩尔 | 〜20 | 〜40 | 〜0.6 | 〜15 | 〜30 | 〜0.45 | |||||||||
10 ù摩尔 | 〜100 | 〜200 | 〜3.0 | 〜75 | 〜150 | 〜2.25 | |||||||||
15 ù摩尔 | 〜150 | 〜300 | 〜4.5 | 〜112 | 〜225 | 〜3.36 | |||||||||
纯度和产率 | 纯度60%至80% 取决于寡核苷酸序列和结构 GC含量高的序列的收率和纯度会更低 不建议用于35 mer以上的寡核苷酸。 ** RPC是使用药筒进行的反相纯化;HPLC的替代品。 | 纯度85%至〜98% 取决于寡核苷酸序列和结构 随着寡核苷酸长度的增加,产量将逐渐降低。回文,发夹和高GC含量的寡核苷酸以及包含3个或更多G链的寡核苷酸会诱导强烈的二级结构和碱基堆积,从而降低纯度和产量。 *不推荐NR | |||||||||||||
*一个。使用高GC含量的寡核苷酸和形成强二级结构的寡核苷酸可观察到产量降低。 b。改性寡核苷酸预计产量会降低。减少百分比随修改类型和站点数量而变化。每个修饰位点的典型减少量为10%-20%。 C。对于等摩尔的碱基组成,计算出的DNA寡核苷酸的产量为33µg / A260。单基或均聚物的长拉伸将具有可变的产率。均聚物20 mer的示例:dA(20)=〜25ug / A260单位;dC(20)=〜40ug / A260单位; dG(20)=〜32ug / A260单位和dT(20)=〜37 ug / A260单位 |