BioChain成立于1994年,总部位于旧金山湾区。
BioChain是高质量的生物样品处理产品和分析服务的,用于推进转化医学,伴随诊断和临床产品研发。BioChain的产品可用于DNA和RNA测序,PCR和RT-PCR,基因表达分析,DNA和RNA纯化,蛋白质提取和纯化以及蛋白质表达分析。从临床样品收集,样品制备,测序到生物信息学分析,BioChain的新一代测序一站式服务将*改变整个行业。
除了我们生物标本和样品制备业务外,BioChain还涉足临床应用,提供癌症和生殖健康方面的临床基因组学诊断产品和临床试验服务。BioChain致力于通过我们的持续过程改进计划以具竞争力的价格获得高质量的产品和服务。BioChain建立了全面的质量保证计划,以满足客户的满意,并为我们的内部生产设施维持ISO9001:2015和ISO 13485:2016认证。
BioChain cfPure®无细胞核酸提取
cfPure®无细胞DNA提取试剂盒 是基于磁珠的DNA提取试剂盒,旨在从人血浆和血清中分离循环的无细胞DNA(cfDNA)。该套件具有快速,简单和自动化友好的协议,使用户能够快速提取高质量的cfDNA,该DNA可用于下游应用,包括实时PCR,数字PCR和下一代测序。
cfPure®无细胞DNA提取试剂盒是BioChain基于磁珠的新型DNA提取试剂盒,旨在从血浆,血清和尿液中分离循环的无细胞DNA(cfDNA)。该试剂盒提供了一种简单且自动化友好的协议,使用户可以从一系列样品量中快速提取高质量的下游cfDNA。
从血浆,血清和尿液中提取高质量的无细胞DNA,用于下一代测序(NGS),亚硫酸氢盐测序,PCR,qPCR,ddPCR和其他苛刻的应用。
cfDNA试剂盒产生可重复的结果
血浆ID | 回收的总DNA(ng) |
---|---|
一种 | 7.00 |
一种 | 7.05 |
乙 | 32.45 |
乙 | 33.50 |
C | 26.80 |
C | 27.70 |
d | 10.90 |
d | 10.90 |
表1.为了评估可重复性,使用cfPure®无细胞DNA提取试剂盒从4种不同人类供体的1 mL血浆中提取DNA,一式两份。
相对于竞争的cfDNA的有效回收
提取套件 | 样品编号 | 每 毫升血浆中回收的cfDNA(ng) | 每毫升血浆(ng)115 nt ALU序列cfDNA(通过PCR) |
---|---|---|---|
竞争对手T | 1个 | 4.99 | 1.97 |
BioChain的cfPure | 1个 | 6.35 | 2.53 |
竞争对手T | 2 | 6.18 | 3.21 |
BioChain的cfPure | 2 | 8.28 | 3.93 |
竞争对手T | 3 | 6.93 | 3.79 |
BioChain的cfPure | 3 | 7.50 | 3.87 |
表2.通过cfPure®无细胞DNA提取试剂盒或竞争对手的基于磁珠的无细胞DNA提取试剂盒,从来自三个不同供体的2 mL血浆中纯化了cfDNA。通过荧光方法或qPCR使用与ALU序列DNA互补的引物评估DNA的回收率。
图1.cfPure®无细胞DNA试剂盒用于从5 ml健康人血浆中分离DNA。回收到62 ng的cfDNA(150-200 bp片段),并带有少量gDNA污染。
图2.使用各种样品体积(.2,.5、1、5、10ml)从两个人类供体的血浆中提取cfDNA。然后通过Qubit高灵敏度DNA测定法定量cfDNA产量。相对于初始样本量绘制产量,并计算其趋势线的R 2值。
通过cfPure萃取cfDNA ® cfDNA Extraction试剂盒是*的下游应用如NGS。在第三方研究cfDNA从10毫升的人血浆用BioChain公司的cfPure提取从4个供体®(B),竞争对手T的(T),和竞争对手Q的(Q,基于列的)cfDNA提取试剂盒。然后为每个样品构建文库,并进行全基因组测序。从数据分析来看,三种提取方法均未显示出明显的性能差异:插入片段大小,作图率,全基因组覆盖率,取代率和GC偏倚。
图3.相对于插入物长度的读取数。每条曲线代表来自相同提取方法的4个样品的平均值。
图4.通过将特定GC含量的读数数除以所有GC箱的平均读数数来计算GC箱中的覆盖率或深度的百分比。数字1表示平均覆盖率,小于1的数字表示低于平均覆盖率,而大于1的数字表示高于平均覆盖率。
cfPure®无细胞DNA提取试剂盒适用于KingFisher™和液体处理仪器。借助KingFisher™Flex和BioChain的cfPure®无细胞DNA提取试剂盒,可在50分钟内提取多达96个1 ml样品,或在一小时内提取24个5 ml样品。
图5.使用KingFisher Flex自动纯化系统和BioChain的cfPure®系统(cfPure KingFisher)或竞争对手的试剂盒(Competitor T KingFisher)从4 mL EDTA血浆中纯化cfDNA。将两种自动提取方法与使用cfPure®(cfPure手动)进行的手动提取进行了比较。使用与ALU重复序列互补的引物通过qPCR评估cfDNA的回收率。
样本类型(常规): | 液体样品(例如血清),dsDNA |
高吞吐量兼容性: | 自动化协议 |
下游应用: | 下一代测序,PCR,实时PCR |
生产线: | cfPure® |
产品尺寸: | 1套 |
运输条件: | 室内温度 |
K5011610 | K5011625 | K5011625MA |
---|---|---|
2 x 1.33 mL cfPure无细胞DNA磁珠 | 5 x 1.33 mL cfPure无细胞DNA磁珠 | 5 x 1.33 mL cfPure无细胞DNA磁珠 |
1 x 115 mL cfPure无细胞DNA裂解/结合液 | 3 x 95 mL cfPure无细胞DNA裂解/结合液 | 1 x 95 mL cfPure无细胞DNA裂解/结合液 |
2 x 55 mL cfPure无细胞DNA洗涤液 | 5 x 55 mL cfPure无细胞DNA洗涤液 | 1 x 65 mL cfPure无细胞DNA洗涤液 |
1 x 6 mL cfPure无细胞DNA洗脱液 | 1 x 15 mL cfPure无细胞DNA洗脱液 | 1 x 15 mL cfPure无细胞DNA洗脱液 |
血液检测与PET-CT成像相结合的可行性,以筛查癌症并指导干预
Lennon AM,Buchanan AH,Kinde I等。
[2020年4月28日在线发布]。 科学。doi:10.1126 / science.abb9601
用 重复元素测序评估非整倍性。
Douville C,Cohen JD,Ptak J,Popoli M,Schaefer J,Silliman N,Dobbyn L,Schoen RE,Tie J,Gibbs P,Goggins M,Wolfgang CL,Wang TL,Shih IM,Karchin R,Lennon AM,Hruban RH ,Tomasetti C,Bettegowda C,Kinzler KW,Papadopoulos N,VogelsteinB。
美国国家自然科学委员会。2020 Mar 3; 117(9):4858-4863。doi:10.1073 / pnas.1910041117。Epub 2020 2月19日。PMID:32075918
游离DNA 在 癌症: 当前 的见解。
Fettke H,Kwan EM,Azad AA。
Cell Oncol(Dordr)。2019二月; 42(1):13-28。doi:10.1007 / s13402-018-0413-5。EPUB 2018年10月26日。评论。
PMID:30367445