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CyteSeer ®自动视频分析软件

 更新时间:2020-12-08 点击量:542

 

CyteSeer ®自动视频分析软件

valasciences. CyteSeer®的胞质ROI实例

CyteSeer通过整理由专有的速度优化算法得出的数据来报告每种药物的效果,这些算法对每个细胞进行分段和识别,然后提取并参数化视频中每个细胞的每个瞬态的形状。

KIC + CyteSeer生成丰富的,可扩展的数据集,这些数据集充分表征了异质细胞的动力学特性,从而能够:

  1. 灵敏度和可预测性,
  2. 人混合细胞/类器官疾病模型的分析,以及
  3. 细胞间健康,例如突触,通讯。

瞬态参数化:心肌细胞图

Cyteseer心肌细胞动作电位图

单线提取
视频,从单个角度观察668个hiPSC心肌细胞(用1.0 uM硝苯地平处理)的6,984个单独动作电位,证明了动力学异质性,这种异质性通常随着候选药物治疗,毒性和模型(例如遗传)疾病而增加。(以30 fps显示。)

心肌细胞动作电位参数化

CyteSeer参数化每个瞬态
CyteSeer生成每个瞬态的详细定量特征,从而能够与已知的人类基准(健康或患病)进行统计比较。

CyteSeer ®视频分割和小区标识
自动识别每个视频捕获的每个小区,并且提取和措施单细胞迹线和单个瞬变。

CyteSeer大数据
CyteSeer可以捕获,简化和报告复杂数据:每天从7,000口井中提取77 TB视频中3千万个细胞中的40亿个参数:

  • 每个单元3-40个瞬态中的每个瞬态都有30个参数(走线上+10)
  • 完整的实时/固定小区HCS

CyteSeer和Vala的专业知识:
通过Vala团队解释CyteSeer的大量数据输出,结果是对候选药物如何影响细胞(功效或副作用)和预测)理解,从而可以有效地对候选候选药物进行排名并实现:

  • 人类临床结果的高可预测性(与动物研究相比)
  • 在线索发现中早对药物进行佳配置(排序)(结合高通量和低成本)