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发布时间:2018/8/15
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5'-Dimethoxytrityl-5-[N-(trifluoroacetylaminohexyl)-3-acrylimido]- 2'-deoxyUridine,3'-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite
Formula: C50H62N6O10F3P
M.W.: 995.05
F.W.: 458.41
5'-二甲氧基三苯甲基-5- [N-(三氟乙酰基氨基己基)-3-丙烯酰亚胺基] -2'-脱氧尿苷,3' - [(2-氰基乙基) - (N,N-二异丙基)] - 亚磷酰胺
分子式:C 5 O H 6 2 N 6 O 1 O F 3 P.
MW:995.05
FW:458.41
稀释剂:无水乙腈
偶联:氨基 - 修饰剂C6dT以与正常亚磷酰胺相同的方式反应。为防止副反应,使用乙酰基保护的dC合成。有关详细信息,请参阅Deprotection。
去保护:合成器制造商推荐的标准方法无需更改。在标准氢氧化铵脱保护过程中除去TFA保护基团。氨脱保护期间的微小副反应可导致不可逆地封端2-5%的胺。如果进行多次添加修饰,则这可能很重要。为了防止反应,使用乙酰基保护的dC合成并在65℃下在30%氨/ 40%甲胺1:1(AMA)中脱保护15分钟。
储存:冷藏,高2-8°C,干燥
溶液稳定性:2-3天
响应: 260nm处DNA的消光系数约为10,000 / mol或10 /μmole。氨基修饰剂C6dT和C2dT的消光系数约为8.7。这些单体的合成不通过脱氧核苷,并且通过与dT-CE亚磷酰胺相比较来估计该数字。
注:dA = 15.4,dC = 7.4,dG = 11.5,T = 8.7
下表显示了包装尺寸数据,以及基于正常灌注程序的溶液,稀释液和近似偶联。
ABI 392/394 | |||||||||
Cat.No. | Pack | Grams/ | 0.1M Dil. | LV40 | LV200 | 40nm | 0.2µm | 1µm | 10µm |
Approximate Number of Additions | |||||||||
10-1039-02 | 0.25grams | .25grams | 2.51 | 70.33 | 42.2 | 26.38 | 19.18 | 14.07 | 3.52 |
10-1039-05 | 0.5grams | .5grams | 5.02 | 154 | 92.4 | 57.75 | 42 | 30.8 | 7.7 |
10-1039-90 | 100µmoles | .1grams | 1 | 20 | 12 | 7.5 | 5.45 | 4 | 1 |
Expedite | |||||||||
Cat.No. | Pack | Grams/ | Dilution | Molarity | 50nm | 0.2µm | 1µm | 15µm | |
Approximate Number of Additions | |||||||||
10-1039-02 | 0.25grams | .25grams | 3.75 | .07 | 68.6 | 42.88 | 31.18 | 4.29 | |
10-1039-05 | 0.5grams | .5grams | 7.5 | .07 | 143.6 | 89.75 | 65.27 | 8.98 | |
10-1039-90 | 100µmoles | .1grams | 1.5 | .07 | 23.6 | 14.75 | 10.73 | 1.48 | |
Glen Research 5'-Modifiers设计用于DNA合成仪,以功能化靶寡核苷酸的5'末端。5'-氨基 - 改性剂可提供各种链长,以*符合所需的应用。
与MMT保护的氨基相比,DMS(O)MT保护的氨基更容易脱保护。硫氧基衍生物在寡核苷酸合成的条件下存活,并且可以用标准解封闭溶液裂解,或保持完整用于HPLC纯化。同时,DMS(O)MT组与滤芯纯化*兼容。当进行盒上的脱三苯甲基化时,DMS(O)MT +,其比MMT +更稳定,不会重新连接到胺。我们现在使用这种新的基于三苯甲基的保护基团提供5'-DMS(O)MT-氨基 - 修饰剂C6。
5'-氨基 - 改性剂TEG,亲水性三甘醇乙胺衍生物,长度为12个原子,*可溶于水性介质中。
项目 | 目录号 | 包 | 价格($) | |
5'-氨基 - 修饰剂C3-TFA | 10-1923-90 | 100微米 | 50.00 | |
10-1923-02 | 0.25克 | 175.00 | ||
5'-氨基 - 修饰剂C6 | 10-1906-90 | 100微米 | 60.00 | |
10-1906-02 | 0.25克 | 200.00 | ||
5'-氨基 - 修饰剂C6-TFA | 10-1916-90 | 100微米 | 30.00 | |
10-1916-02 | 0.25克 | 100.00 | ||
5'-氨基 - 修饰剂C12 | 10-1912-90 | 100微米 | 90.00 | |
10-1912-02 | 0.25克 | 300.00 | ||
5'-氨基 - 修饰剂5 | 10-1905-90 | 100微米 | 60.00 | |
10-1905-02 | 0.25克 | 200.00 | ||
5'-DMS(O)MT-氨基 - 修饰剂C6 | 10-1907-90 | 100微米 | 60.00 | |
10-1907-02 | 0.25克 | 200.00 | ||
5'-氨基 - 修饰剂TEG CE-亚磷酰胺 | 10-1917-90 | 100微米 | 115.00 | |
10-1917-02 | 0.25克 | 500.00 | ||
CE =氰乙基
CNEt =氰乙基
CPG =受控孔径玻璃
DMT = 4,4'-二甲氧基 三苯甲基
Fmoc =芴基甲氧基羰基
iPr =异丙基
lcaa =长链烷基氨基
μm=微摩尔
MMT = 4-单甲氧基三苯甲基
nm =纳摩尔
T =三苯甲基
TBDMS =叔丁基 - 二甲基甲硅烷基
TFA =三氟乙酰基
我们的5'-氨基改性剂,由新型邻苯二甲酸二酰胺(PDA)保护基团保护,是稳定的固体。与作为粘性油的TFA保护的氨基改性剂相反,类似的PDA保护的化合物是粒状粉末。这些化合物的这一重要特性允许直接处理,储存和等分,并导致稳定性的显着增加。
用甲胺在气相或水溶液或AMA中脱保护导致快速和*除去PDA保护基团。然而,氢氧化铵不会使平衡反应完成并且仅发生部分脱保护 - 用氢氧化铵过夜脱保护将产生约80%活性胺。
我们提供三种PDA Amino-Modifiers:
5'-氨基 - 修饰剂C6-PDA
疏水性5'-氨基 - 修饰剂C12-PDA
亲水性5'-氨基 - 修饰剂-TEG-PDA
PDA氨基改性剂由Stefan Pitsch和ReseaChem GmbH(S.Berger)开发,正在申请。
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱,请将以下内容添加到目录号的末尾。
二硫化物硫醇改性剂可用于引入3'-或5'-硫醇键。Dithiol Serinol,由硫辛酸和我们的丝氨醇骨架生产,可以轻松连接多个二硫醇标记的寡核苷酸到金表面。5'-羧基 - 修饰剂C10是设计为在寡核苷酸合成的末端添加的*接头。它产生活化的羧酸N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯,其适合于在含有伯胺的分子的合成柱上立即缀合,产生稳定的酰胺键。另一种羧酸盐保护基团是2-氯三苯甲基基团,其使用标准去封闭循环简单地除去,以在另外*保护的寡核苷酸上产生游离羧基。2-氯三苯甲基基团在用氢氧化铵或AMA进行低聚脱保护期间也被除去,并且与RP纯化技术不相容。PC Amino-Modifier是一种光可裂解的C6氨基改性剂,是我们的光可裂解(PC)改性剂系列的一部分。5'-氨基氧基 - 修饰剂11基于四乙二醇键,用于改善溶解度和减少对寡核苷酸杂交的潜在负面影响。由烷氧基胺与醛反应形成的肟形成稳定的共价键。相比之下,通过伯胺与醛的共轭形成的亚胺对酸性或碱性条件不稳定,并且需要随后用硼氢化物还原以形成稳定的胺缀合物。5'-马来酰亚胺改性剂亚磷酰胺,由巴塞罗那大学开发,含有马来酰亚胺环加成物,在室温下对氢氧化铵稳定。该亚磷酰胺可以与磷酸酯和硫代磷酸酯键结合到DNA和RNA中。retro-Diels-Alder反应在缀合之前立即使马来酰亚胺脱保护。
项目 | 目录号 | 包 | 价格($) | |
5'-硫醇 - 改性剂C6 | 10-1926-90 | 100微米 | 60.00 | |
10-1926-02 | 0.25克 | 200.00 | ||
硫醇 - 改性剂C6 SS | 10-1936-90 | 100微米 | 150.00 | |
10-1936-02 | 0.25克 | 360.00 | ||
二硫醇丝氨醇亚磷酰胺 | 10-1991-95 | 为50μm | 120.00 | |
10-1991-90 | 100微米 | 215.00 | ||
10-1991-02 | 0.25克 | 585.00 | ||
PC氨基改性剂亚磷酰胺 | 10-4906-90 | 100微米 | 135.00 | |
10-4906-02 | 0.25克 | 395.00 | ||
5'-羧基 - 改性剂C10 | 10-1935-90 | 100微米 | 65.00 | |
10-1935-02 | 0.25克 | 265.00 | ||
5'-羧基 - 改性剂C5 | 10-1945-90 | 100微米 | 95.00 | |
10-1945-02 | 0.25克 | 330.00 | ||
5'-氨氧基 - 改性剂-11-CE亚磷酰胺 | 10-1919-95 | 为50μm | 140.00 | |
10-1919-90 | 100微米 | 265.00 | ||
10-1919-02 | 0.25克 | 895.00 | ||
5'-马来酰亚胺 - 改性剂亚磷酰胺 | 10-1938-90 | 100微米 | 70.00 | |
10-1938-02 | 0.25克 | 335.00 | ||
5'-Carboxy-Modifier C10经TriLink BioTechnologies,Inc。许可销售。它仅用于研究和开发目的,不得用于商业,临床,诊断或任何其他用途。它包含在美国No.6,320,041中。
5'-马来酰亚胺改性剂亚磷酰胺受申请保护,由Glen Research根据巴塞罗那大学的许可协议提供。
Glen Research与AmberGen,Inc。和Link Technologies,Ltd。联合提供PC Biotin,PC Amino-Modifier和PC Spacer产品。Serinol产品由美国号8,394,948涵盖。
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱,请将以下内容添加到目录号的末尾。
序列修饰符设计用于自动合成。羧基-dT在脱保护过程中水解,并且可以通过标准肽偶联或通过中间体N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯直接与含有伯氨基的分子偶联。在寡核苷酸合成期间,可分别加入氨基 - 修饰剂dA,氨基 - 修饰剂dC,N2-氨基 - 修饰剂dG和两种氨基 - 修饰剂dT产物代替dA,dC,dG和dT残基。相应的氨基 - 修饰物支持物可以取代它们各自的脱氧核苷支持物。脱保护后,C6类似物上的伯胺通过具有总共7-10个原子的间隔臂与寡核苷酸分离,并且可以标记或附着于酶。
项目 | 目录号 | 包 | 价格($) | |
氨基修饰剂C6 dA | 10-1089-90 | 100微米 | 205.00 | |
10-1089-02 | 0.25克 | 455.00 | ||
氨基修饰剂C6dC | 10-1019-90 | 100微米 | 225.00 | |
10-1019-02 | 0.25克 | 450.00 | ||
N2-氨基 - 改性剂C6dG | 10-1529-95 | 为50μm | 240.00 | |
10-1529-90 | 100微米 | 480.00 | ||
10-1529-02 | 0.25克 | 1100.00 | ||
羧基的dT | 10-1035-90 | 100微米 | 180.00 | |
10-1035-02 | 0.25克 | 360.00 | ||
氨基修饰剂C2 dT | 10-1037-90 | 100微米 | 180.00 | |
10-1037-02 | 0.25克 | 360.00 | ||
10-1037-05 | 0.5克 | 720.00 | ||
氨基修饰剂C6 dT | 10-1039-90 | 100微米 | 180.00 | |
10-1039-02 | 0.25克 | 360.00 | ||
10-1039-05 | 0.5克 | 720.00 | ||
窗体顶端
窗体底端
我们的NHS酯衍生物库已经扩展到包括NHS-羧基-dT-CE亚磷酰胺。通过制备羧基 - 修饰物C10的dT类似物,可以标记寡核苷酸内的一个或多个位点。当亚磷酰胺不可用时,这开辟了在寡核苷酸内标记任何数量的不同染料或分子的可能性。这样做很简单,可以在合成器上手动完成,甚至可以在DNA合成器上以全自动方式完成。
我们从未发现允许TFA组从氨基修饰剂中除去而寡核苷酸保持与支持物连接的条件。我们能够通过使用9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)保护基来解决这个问题。使用两步法除去Fmoc基团,步除去氰乙基保护基团,用乙腈中的1%二异丙胺从合成柱中冲洗形成的丙烯腈,第二步用10%哌啶的DMF溶液除去Fmoc基团。在柱上形成的氨基可以与各种活化酯反应。我们提供Fmoc-氨基修饰剂C6 dT亚磷酰胺作为核苷选择,氨基修饰剂Serinol亚磷酰胺作为非核苷替代物。我们还提供S-Bz-Thiol-Modifier C6-dT,以加入用于寡核苷酸合成的硫醇修饰剂等级。硫醇 - 改性剂C6-dT可以照常添加到序列内的所需位置。
Serinol产品由美国号8,394,948涵盖。
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱,请将以下内容添加到目录号的末尾。
含有用碱不稳定Fmoc基团保护的氨基的3'-氨基 - 修饰物CPG被设计成通过引入伯胺来官能化靶寡核苷酸的3'末端。在另一种方法中,注定成为3'-氨基的氮包括在邻苯二甲酰亚胺(PT)基团中,该基团通过与芳环连接的酰胺基团与载体连接。这种简单的连接对于寡核苷酸合成的所有条件都是非常稳定的,并且不含手性中心。使用延长的氢氧化铵处理(55℃,17小时),从邻苯二甲酰亚胺中裂解胺,同时脱保护寡核苷酸。除非另有要求,否则提供ABI型柱。
3'-硫醇 - 修饰剂SS CPG载体用于将具有3和6个原子间隔区的3'-硫醇键引入寡核苷酸中。3'-二硫醇丝氨醇CPG用于在3'末端引入二硫醇基团。与Dithiol Serinol亚磷酰胺一起,很容易在3'末端产生具有多个硫醇基团的寡核苷酸,这是与金表面结合的理想选择。对于甘油CPG,寡核苷酸的3'末端易被高碘酸钠氧化形成3'-磷酸甘油醛。醛可以进一步氧化成相应的羧酸。醛或羧酸盐可以用于随后与含胺产物的缀合。
3'-硫醇 - 改性剂6 SS CPG由Berry&Associates公司开发,并在Berry&Associates的协议下销售。
Serinol产品由美国号8,394,948涵盖。
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱,请将以下内容添加到目录号的末尾。
3'-氨基 - 修饰剂C6dC CPG和3'-氨基 - 修饰剂C6dT CPG分别在3'末端取代dC和T. 这些产品可以方便地在3'标记,而不会阻止末端产生所需的酶活性。
化学磷酸化试剂常用于磷酸化寡核苷酸的5'-末端。尽管该产物在3'-磷酸化中也是成功的,但3'-磷酸CPG允许直接制备具有3'-磷酸基团的寡核苷酸。化学磷酸化试剂II在侧链上含有DMT基团,其对碱基切割是稳定的并且可以留在寡核苷酸上用于RP纯化。随后用酸水溶液除去DMT组,用氢氧化铵水溶液短暂处理后除去侧链,得到5'-磷酸盐.1固体CPR II的性能与CPR II相似,但更容易制备等分试样,因为它是粉末。许多研究人员用受阻碱(例如二乙胺,二异丙基乙胺,或DBU)后合成以消除和除去氰乙基磷酸酯基团。以这种方式,原位形成的丙烯腈从载体上除去,并且不能使寡聚物中N3位的dT残基烷基化。由于3'-磷酸CPG中的磺基乙基也易于β-消除,导致寡核苷酸裂解,因此该技术与3'-磷酸CPG不相容。使用基础不稳定但不支持β-消除的CPR II CPG,可以在切割和碱基去保护之前从寡核苷酸中除去氰乙基。除非另有要求,否则提供ABI型样品瓶和色谱柱。原位形成的丙烯腈从载体上除去,不能使寡核苷酸中N3位的dT残基烷基化。由于3'-磷酸CPG中的磺基乙基也易于β-消除,导致寡核苷酸裂解,因此该技术与3'-磷酸CPG不相容。使用基础不稳定但不支持β-消除的CPR II CPG,可以在切割和碱基去保护之前从寡核苷酸中除去氰乙基。除非另有要求,否则提供ABI型样品瓶和色谱柱。原位形成的丙烯腈从载体上除去,不能使寡核苷酸中N3位的dT残基烷基化。由于3'-磷酸CPG中的磺基乙基也易于β-消除,导致寡核苷酸裂解,因此该技术与3'-磷酸CPG不相容。使用基础不稳定但不支持β-消除的CPR II CPG,可以在切割和碱基去保护之前从寡核苷酸中除去氰乙基。除非另有要求,否则提供ABI型样品瓶和色谱柱。在裂解和碱去保护之前,可以从寡聚物中除去氰乙基。除非另有要求,否则提供ABI型样品瓶和色谱柱。在裂解和碱去保护之前,可以从寡聚物中除去氰乙基。除非另有要求,否则提供ABI型样品瓶和色谱柱。
固体化学磷酸化试剂II和相关载体包括在欧洲EP0816368中。
A. Guzaev,A.Azhayev和H. Lonnberg,Tetrahedron,1995,51,9375-9384。
醛改性剂在寡核苷酸中是有吸引力的亲电子取代,因为它们能够与氨基反应形成席夫碱,肼基形成腙,并与氨基脲形成半咔唑酮
我们与以前的Epoch Biosciences的ELITechGroup合作,使我们能够提供5'-醛改性剂C2亚磷酰胺。缩醛保护基团具有足够的疏水性,可用于RP HPLC和柱纯化,并且在标准寡核苷酸脱三苯甲基化条件下用80%乙酸/ 20%水或2%三氟yi酸水溶液在寡核苷酸合成过程中容易除去。
甲酰基吲哚核苷类似物已用于在寡核苷酸内或5'末端引入醛基。该产物在醛上没有保护基团,这意味着可以在不改变优选条件的情况下进行修饰寡核苷酸的去保护。
本产品仅用于研究目的,不得用于商业,临床,诊断或任何其他用途。本产品受ELITechGroup的所有权所有,并由ELITechGroup许可制造和销售。对于这些产品,没有商业用途的隐含许可,并且必须直接从ELITechGroup获得有关这些产品的任何拟议商业用途的许可。“商业用途"包括但不限于产品的销售,租赁,许可或其他转让或从中衍生或生产的任何材料,销售,租赁,许可或其他授权使用产品或任何衍生材料或由其生产,或使用本产品为第三方收取服务(包括合同研究)。
在终用户和定制寡核苷酸服务可以购买这些产品以供上述定义使用之前,必须签署一份简单的协议。
间隔子亚磷酰胺C3,9,C12和18用于在寡核苷酸中插入间隔臂。当需要较长的间隔物时,可以多次添加化合物。3'-间隔区C3 CPG还可以在3'末端充当外切核酸酶和聚合酶活性的阻断剂。dSpacer用于在寡核苷酸内引入稳定的无碱基位点。PC Spacer是一种可光裂解的C3间隔物改性剂,是我们的光可裂解(PC)改性剂系列的一部分。
知识产权
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。
树枝状聚合物是离散的,高度支化的,单分散的聚合物,其具有令人联想到树木分枝的图案。可以使用新型双倍和三倍体亚磷酰胺合成子合成平原和混合寡核苷酸树枝状大分子。1,2 树枝状大分子具有以下优点。使用g- 32掺入标记P-ATP和多核苷酸激酶与5'-末端的数量成比例地增加。如果在标签和分支的末端之间加入间隔物,则荧光信号也与5'末端的数量成比例地增加。当使用树枝状聚合物寡核苷酸作为PCR引物时,带有树枝状聚合物的链对T7基因6外切核酸酶的降解具有抗性,使得易于将PCR的双链产物转化为多重标记的单链探针。DNA树枝状聚合物的稳定性增强使它们可用作纳米组装“自下而上"方法的构建模块。当需要更高的温度时,这些特征还表明在DNA芯片技术中的应用,例如,熔化靶中的二级结构。
这些产品由牛津大学创新有限公司许可提供。
MS Shchepinov,IA Udalova,AJ Bridgman和EM Southern,Nucleic Acids Res,1997,25,4447-4454。
MS Shchepinov,KU Mir,JK Elder,MD Frank-Kamenetskii和EM Southern,Nucleic Acids Res,1999,27,3035-41。
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需要支化单体来构建梳状寡核苷酸探针。来自Chiron公司的梳子系统的评估了1个分支点的保护基团并选择了乙酰丙酰基(LEV),其使用含有水合肼,乙酸和吡啶的试剂特异性地除去。
T. Horn,CA Chang和MS Urdea,Nucleic Acids Res,1997,25,4842-4849。
PC生物素亚磷酰胺可用于制备5'-生物素化的寡核苷酸,其适合于通过链霉抗生物素蛋白以类似于我们流行的5'生物素亚磷酰胺的方式捕获。已证明氨基和硫醇修饰的寡核苷酸非常适用于各种半抗原和荧光团的连接,以及寡核苷酸与多种珠子和表面的连接。PC氨基 - 修饰剂亚磷酰胺用于制备适于随后光切割的5'-氨基修饰的寡核苷酸。PC Spacer亚磷酰胺可用作中间体,将任何可用作亚磷酰胺的修饰试剂连接到寡核苷酸的末端。光切割后,DNA上产生5'-磷酸,使其适合进一步的生物转化,
密苏里州华盛顿大学的研究人员描述了一种多功能光可裂解DNA构建模块,并用于光触发杂交。1 该试剂还用于设计多功能DNA和RNA结合物2,用于体外选择催化生物分子反应的新分子。德国Bruker Daltonik的研究人员还开发了genoSNIP,这是一种通过MALDI-TOF质谱进行单核苷酸多态性(SNP)基因分型的方法。3该方法通过掺入光可切割接头使用引物延伸产物的尺寸减小,用于在延伸引物的3'末端附近的光触发链断裂。PC Linker可通过标准自动DNA合成方法在任何位置掺入寡核苷酸中。PC连接子亚磷酰胺具有额外的优点,即光切割在寡核苷酸片段的3'和5'末端都产生单磷酸酯片段。
Glen Research与AmberGen,Inc。和Link Technologies,Ltd。联合提供PC Biotin,PC Amino-Modifier和PC Spacer产品。
P. Ordoukhanian和JS。泰勒,J。Am。化学。Soc。,117,9570-9571,1995。
(a)F。Hausch和A.Jäschke,Nucleic Acids Research,2000,28,e35。
(b)F。Hausch和A.Jäschke,Tetrahedron,2001,57,1261-1268。
T. Wenzel,T.Elssner,K.Fahr,J.Bimmler,S.Richter,I.Thomas,和M.Kostrzewa,Nucleosides,Nucleotides&Nucleic Acids,2003,22,1579-1581。
所有次要碱基,RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱,请将以下内容添加到目录号的末尾。
铜(I)的叠氮化物和炔烃,以形成1,2,3-三唑之间催化的叠氮化物-炔环加成加成(CuAAC)反应,据报道1由夏普勒斯,被发现是如此精致的区域选择性和率在即使是温和的条件Sharpless创造了“点击化学"一词来形容它。由于铜离子损害DNA,通常产生链断裂,因此这种方法用于DNA修饰的用途有所延迟。2现在通过使用铜(I) - 稳定配体(例如,三(苄基三唑基甲基)胺,TBTA 3)克服了这些问题,Carell等人。和Seela等人。发现CuAAC反应可用于以*的效率使炔烃修饰的DNA核碱基官能化。4
带有单个核苷炔基的寡核苷酸可以使用C8-炔烃-dC或dT-CE亚磷酰胺制备。纯化的寡核苷酸通常用2-5当量的相应标记物 - 叠氮化物(例如荧光染料叠氮化物)修饰。在加入预络合的Cu(I)后,在30分钟至4小时的时间跨度内观察到*转化为标记的寡聚物。在简单的沉淀步骤后,可以接近定量的产率回收标记的寡核苷酸。使用C8-炔烃,C8-TIPS-炔烃和C8-TMS-炔烃的组合,可以在多三次单独的点击反应中标记寡核苷酸。后两种单体上的炔基分别用三异丙基甲硅烷基(TIPS)和san甲基甲硅烷基(TMS)保护基团保护。5,6 在C8-炔烃上的固相上的次点击反应产生单一修饰的寡核苷酸,其*保留TIPS和/或TMS保护基团。对于双击,使用C8-TIPS-炔烃作为第二核苷,并且用氟化四丁基铵(TBAF)裂解TIPS保护基团而不对DNA造成任何损害。溶液中的第二次点击反应以*的产率产生双重修饰的寡核苷酸。为了引入三种不同的标记,将所有三种核苷引入寡核苷酸中。次点击反应直接在树脂上进行。随后将单独修饰的寡核苷酸从载体上切下,同时切割TMS基团并保留TIPS保护基团。第二次点击反应在溶液中进行。
baseclick的所有产品均受保护,可与baseclick合作。
Baseclick GmbH已提交以下申请:
1.WO2006 / 117161,用于敏感检测分析物的新标记策略。
2.WO2008 / 952775,Click Chemistry用于产生报告分子。
Baseclick GmbH拥有“The Scripps Research Institute"的“Click Chemistry"研究市场的许可证:
3. WO03 / 101972,叠氮化物和乙炔的铜催化连接。
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5-乙炔基-dU提供与叠氮化物的方便的点击缀合,以产生与寡核苷酸碱基之一刚性连接的标记。5-乙炔基-dU在裂解和去保护过程中经历碱催化水合,特别是当使用强碱或加热时。乙炔基的水合形成甲基酮,其随后阻止潜在的点击反应。当使用5-乙炔基-dU-CE亚磷酰胺以防止该副反应时,需要温和的脱保护条件。TIPS-5-Ethynyl-dU-CE亚磷酰胺含有受保护的炔烃,与寡核苷酸合成和脱保护具有更广泛的相容性。用三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基保护5-乙炔基可防止寡核苷酸合成和后处理过程中酸或碱催化的水合作用。
除其他申请(4-5)外,baseclick GmbH还获得了以下(1-3)。
1.WO 2006/117161(用于敏感检测分析物的新标记策略)
2.WO 2008/952775(点击化学用于产生报告分子)
3.WO 2010/115957(非均相催化剂上的化学)
4. PCT / EP2013 / 064610(Anandamide修饰的核酸分子)
5. PCT / EP 2015/056007(DNA折纸的自组装:诊断工具)
baseclick GmbH拥有授权申请
WO 03/101972(用于核酸领域的铜催化的叠氮化物和乙炔的连接)在诊断和研究领域。由于Glen Research和baseclick是合作伙伴,Glen Research现在能够帮助对这项杰出技术进行再许可
使用5'-己烯基亚磷酰胺制备的寡核苷酸对标准脱保护条件是稳定的,并且在RP HPLC上显示略微增加的保留时间。叠氮化物与使用亚磷酰胺的寡核苷酸合成不相容,因此需要后合成反应。叠氮基丁酸酯NHS酯使用1在任一3'-末端或低聚的5'-末端胺的叠氮基修饰和它甚至可以用于在序列内的氨基-修饰-C6 DX残余内部修饰。具体到5'-末端,在后一个循环中加入5'-溴己基亚磷酰胺。然后通过使用叠氮化na置换溴化物,可以容易地将该改性剂转化为5'-叠氮基。2炔烃NHS酯允许多种分子中的氨基部分的官能化,包括DNA和RNA寡核苷酸以及肽或蛋白质。我们还提供两种用于Click化学的产品,基于我们的1,3-二醇产品组合,其中含有丝氨醇骨架 - 用于在5'末端或序列内添加炔基的亚磷酰胺,以及用于标记3的化合物支持。 '具有炔基的寡核苷酸的末端。
1-乙炔基-dSpacer CE亚磷酰胺可用于寡核苷酸内的任何位置,同时仍保持的点击化学。使用标准亚磷酰胺化学将改性剂有效地掺入寡核苷酸中,对常见的脱保护条件是稳定的,并且与Glen-Pak TM纯化相容。1-炔基-dSpacer在与叠氮化物点击化学结合后产生取代的1,2,3-三唑假核碱基1-乙炔基-dSpacer修饰物表现出与标准dSpacer(10-1914)相似的双链体稳定性并且当双链体不稳定时内部合并。在环加成后,通过所得的修饰结构来调节双链体稳定性。简单的1,2,3-三唑是不稳定的,结合TEG接头(6-FAM-TEG和Amino-TEG)的修饰也是如此。
5'-碘修饰的寡核苷酸(使用5'-Iodo-dT制备)可以定量转化为相应的5'-叠氮化物
除了在室温下在氢氧化铵中进行脱保护24小时之外,常规制备含有5'-碘基的寡核苷酸。在这些条件下,碘基的降解小于2%。
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Oligo-Click Kits在预装和即用型小瓶中含有颗粒形式的空气稳定的不溶性Cu(I)源。在试剂盒中,TBTA配体被活化剂取代,活化剂与水溶剂和有机溶剂相容。催化剂和配体/活化剂的这种创新组合使得标签工作流程更加简单,只需三个简单的步骤。通过CuAAC标记寡核苷酸的制备现在仅需要几分钟或甚至更少的小手动操作时间,并且可以在空气中进行而无需任何额外的预防措施。Glen Research与baseclick GmbH合作提供以下套件。
在Glen Research,我们的目标是提供具有以下特性的无铜点击亚磷酰胺试剂:
简单易用
在合成器上稳定解决方案
对氢氧化铵和AMA稳定
在室温下17小时或更短时间内具有出色的咔嗒性能
从迄今描述的各种基于环辛炔的无铜点击试剂,我们选择提供基于二苯并环辛炔(DBCO)结构的化合物。我们提供5'-DBCO-TEG亚磷酰胺用于制备具有5'-DBCO修饰的寡核苷酸和DBCO-dT-CE亚磷酰胺用于在寡核苷酸内的任何位置插入DBCO基团。此外,我们还提供DBCO亚磷酰胺 - DBCO-丝氨醇亚磷酰胺。使用我们专有的serinol骨架作为非核苷间隔物,可以将DBCO组放置在序列中的任何位置,并且可以清楚地进行多次添加。DBCO-磺基-NHS酯也用于合成后的缀合反应。DBCO-修饰的寡核苷酸可以在有机溶剂(例如DMSO)或水性缓冲液中与叠氮化物缀合。取决于使用的叠氮化物,反应将在室温下在4-17小时内完成。Glen Gel-Pak™上的简单脱盐使得产品具有几乎定量的结合效率。
注意:我们现在建议使用0.5M CSO的无水乙腈(40-4632-xx)完成含有DBCO-dT的寡核苷酸的合成。如果DBCO-dT经历不超过8-10次循环,则可以通过碘氧化实现可接受的结果。
Glen Research首先提供我们欢迎的标签,然后我们将添加与亚磷酰胺化学不相容的叠氮化物产品。
生物素仍然是我们常用的标签和生物素,其亲水性三甘醇间隔物是生物素产品。Desthiobiotin是一种生物素类似物,很好地被链霉抗生物素蛋白捕获,但通过将生物素溶液应用于链霉抗生物素蛋白珠,可以很容易地释放捕获的产物。6-FAM是我们的荧光素衍生物,我们提供6-FAM和新戊酰保护的6-FAM的叠氮化物,用于后续反应需要保护6-FAM的情况。在两种6-FAM产品中,再次使用亲水性TEG间隔物。叠氮化物以25和100μmole包装提供,以方便寡核苷酸标记。
7-Hydroxycoumarin,也称为伞形酮,是一种高荧光,pH敏感的荧光团,发射在光谱的蓝色区域。然而,如果羟基被烷基化或磷酸化,其荧光强烈淬灭,使其可用于磷酸酶和脂肪酶的高通量筛选。
HEX和TET是我们常用的两种荧光素染料,用于标记寡核苷酸。我们很高兴提供6-HEX和6-TET叠氮化物用于点击变换。
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现在提供两种硝基氧自旋标记,TEMPO叠氮化物和TEMPO-TEG叠氮化物,用于定点自旋标记(SDSL)。
点击化学与补骨脂素叠氮化物和我们的许多核苷和非核苷烷衍生物之一有可能产生各种实际的交联剂。补骨脂素与邻近的胸苷残基的*的可逆交联行为可能是非常有用的。
为了更好地解决近红外(NIR)成像应用,Glen Research提供了一种水溶性的Disulfo-Cyanine 7叠氮化物,可以通过标准点击化学方法轻松地与DNA和RNA结合。这种长波长染料具有改善溶解性,减少聚集,改善近红外光谱稳定性以及点击化学方便性的优点。
货号 | 品名 | 规格 | 目录价 | 品牌 |
10-0001-02 | dA-5'-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 1275 | glen research |
10-0001-05 | dA-5'-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 2550 | glen research |
10-0001-10 | dA-5'-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 5100 | glen research |
10-0101-02 | dC-5'-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 1275 | glen research |
10-0101-05 | dC-5'-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 2550 | glen research |
10-0101-10 | dC-5'-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 5100 | glen research |
10-0301-02 | dT-5'-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 1275 | glen research |
10-0301-05 | dT-5'-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 2550 | glen research |
10-1015-50 | Ac-dC-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1015-5S | Ac-dC-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1015-C2 | Ac-dC-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1015-C5 | Ac-dC-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1016-02 | TMP-F-dU-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 8415 | glen research |
10-1016-90 | TMP-F-dU-CE Phosphoramidite | 100µmoles | 3315 | glen research |
10-1017-02 | Pyrrolo-dC-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 11475 | glen research |
10-1017-90 | Pyrrolo-dC-CE Phosphoramidite | 100µmoles | 3740 | glen research |
10-1017-95 | Pyrrolo-dC-CE Phosphoramidite | 50µmoles | 1870 | glen research |
10-1018-02 | 5-Me-dC Brancher Phosphoramidite | 0.25grams | 8585 | glen research |
10-1018-90 | 5-Me-dC Brancher Phosphoramidite | 100µmoles | 3485 | glen research |
10-1019-02 | Amino-Modifier C6 dC | 0.25grams | 7650 | glen research |
10-1019-90 | Amino-Modifier C6 dC | 100µmoles | 3825 | glen research |
10-1020-02 | dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1020-02M | dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1020-05 | dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1020-05M | dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1020-10 | dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1020-10M | dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1020-1C | dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1020-1S | dG-CE Phosphoramidite | 10.0grams | 8500 | glen research |
10-1020-20 | dG-CE Phosphoramidite | 2.0grams | 1700 | glen research |
10-1020-2C | dG-CE Phosphoramidite | 2.0grams | 1700 | glen research |
10-1020-40 | dG-CE Phosphoramidite | 4.0grams | 3400 | glen research |
10-1020-50 | dG-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1020-5S | dG-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1020-C2 | dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1020-C5 | dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1021-02 | 7-deaza-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 16575 | glen research |
10-1021-90 | 7-deaza-dG-CE Phosphoramidite | 100µmoles | 6035 | glen research |
10-1021-95 | 7-deaza-dG-CE Phosphoramidite | 50µmoles | 3017.5 | glen research |
10-1023 | dA+dC+dG+dT-CE Phosphoramidite Mix | 1.0gram | 680 | glen research |
10-1027-02 | 8-Br-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 4335 | glen research |
10-1027-90 | 8-Br-dG-CE Phosphoramidite | 100µmoles | 1785 | glen research |
10-1028-02 | 8-oxo-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 16575 | glen research |
10-1028-90 | 8-oxo-dG-CE Phosphoramidite | 100µmoles | 6035 | glen research |
10-1028-95 | 8-oxo-dG-CE Phosphoramidite | 50µmoles | 3017.5 | glen research |
10-1029-02 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1029-02M | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1029-05 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1029-05M | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
10-1029-10 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1029-10M | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1029-1C | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 1.0gram | 850 | glen research |
10-1029-1S | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 10.0grams | 8500 | glen research |
10-1029-20 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 2.0grams | 1700 | glen research |
10-1029-2C | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 2.0grams | 1700 | glen research |
10-1029-40 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 4.0grams | 3400 | glen research |
10-1029-50 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1029-5S | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 5.0grams | 4250 | glen research |
10-1029-C2 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.25grams | 212.5 | glen research |
10-1029-C5 | dmf-dG-CE Phosphoramidite | 0.5grams | 425 | glen research |
上海起发实验试剂有限公司是实验试剂一站式采购服务商
1:*的进口辐射能力,血清、抗体、耗材、大部分限制进口品等。
2:产品种类齐全,经营超过700多品牌,基本涵盖所有生物实验试剂耗材。
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6:我们还是Santa,Advanced Biotechnologies Inc,Athens Research & Technology,bangs,BBInternational,crystalchem,dianova,FD Neurotechnologies,Inc. FormuMax Scientific,Inc, Genebridege, Glycotope Biotechnology GmbH; iduron,Innovative Research of America, Ludger, neuroprobe,omicronbio, Polysciences,prospecbi, QA-BIO,quickzyme,RESEARCH DIETS,INC,sterlitech;sysy,TriLink BioTechnologies,Inc;worthington-biochem,zyagen等几十家国外公司授权代理。
7:我们还是invitrogen,qiagen,MiraiBioam,sigma;neb,roche,merck, rnd,BD, GE,pierce,BioLegend等知*批发,欢迎合作。