2'- Fluoro-NTP在新药开发和研究中的利用数量逐渐增加。同时也用于寡核苷酸适配子和siRNA的设计和合成，增强外源DNA在生物体内的稳定性。

Aminoallyl修饰的核苷三磷酸为高密度的DNA标记提供一个更有效的方法，Aminoallyl NTPS用于PCR中的DNA间接标记，缺口平移，引物延伸反应和cDNA合成。